Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klra1P20937 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms