Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps6ka1P18653 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms