Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhoP15409 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhoP15409 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhoP15409 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhoP15409 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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