Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrgnP13609 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrgnP13609 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms