Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FosbP13346 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FosbP13346 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FosbP13346 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FosbP13346 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FosbP13346 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FosbP13346 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FosbP13346 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FosbP13346 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FosbP13346 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms