Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DmdP11531 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DmdP11531 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DmdP11531 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DmdP11531 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DmdP11531 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DmdP11531 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DmdP11531 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DmdP11531 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DmdP11531 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DmdP11531 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DmdP11531 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DmdP11531 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms