Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PolP10400 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms