Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CatspereP0DP43 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms