Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ifna9P09235 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ifna9P09235 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms