Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NefmP08553 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefmP08553 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NefmP08553 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefmP08553 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefmP08553 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefmP08553 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefmP08553 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefmP08553 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefmP08553 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms