Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TnfP06804 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms