Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01740 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01740 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01740 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01740 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms