Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms