Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ccl20O89093 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl20O89093 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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