Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JtbO88824 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JtbO88824 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
JtbO88824 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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