Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms