Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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