Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tspan6O70401 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan6O70401 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms