Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtssO70370 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtssO70370 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtssO70370 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtssO70370 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtssO70370 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtssO70370 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtssO70370 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtssO70370 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms