Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx2O70340 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms