Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lnx1O70263 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms