Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Foxq1O70220 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Foxq1O70220 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms