Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja1O55176 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms