Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LatO54957 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LatO54957 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LatO54957 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LatO54957 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LatO54957 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LatO54957 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms