Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbrO54799 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbrO54799 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms