Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf12O35738 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf12O35738 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms