Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Opn1mwO35599 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Opn1mwO35599 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Opn1mwO35599 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Opn1mwO35599 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Opn1mwO35599 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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