Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx1aO35526 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stx1aO35526 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms