Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Prrt1O35449 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prrt1O35449 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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