Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ebi3O35228 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ebi3O35228 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ebi3O35228 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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