Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms