Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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