Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms