Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC024978J3QPC3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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BC024978J3QPC3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC024978J3QPC3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC024978J3QPC3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC024978J3QPC3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC024978J3QPC3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms