Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smim22J3QP37 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim22J3QP37 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim22J3QP37 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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