Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6408J3QNG1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6408J3QNG1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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