Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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