Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms