Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm21818J3KMS6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm21818J3KMS6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21818J3KMS6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21818J3KMS6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21818J3KMS6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm21818J3KMS6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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