Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm17535J3KMR8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17535J3KMR8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17535J3KMR8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17535J3KMR8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17535J3KMR8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17535J3KMR8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17535J3KMR8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17535J3KMR8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17535J3KMR8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17535J3KMR8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm17535J3KMR8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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