Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnmal2G3X9N3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms