Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp72F8VQC1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp72F8VQC1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp72F8VQC1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp72F8VQC1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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