Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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