Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh9F8VPK8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms