Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms