Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc149F6V035 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms