Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms