Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd7E9Q9W7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms