Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip11E9Q512 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms