Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9972E9Q053 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms